Flore d'intérêt communautaire :
- Dracocéphale d'Autriche : station unique aux effectifs très faibles, pas de menace anthropique mais l'embroussaillement est à surveiller.
- Sabot de Vénus : de petites stations disséminées dans les forêts du site, pas d'enjeu majeur pour cette espèce sur le site.
- Ancolie de Bertoloni : effectifs très importants dans le sud du site, pas de menaces.
- Buxbaumie verte : mal connue, tributaire d'une gestion forestière conservant du bois mort.
- Serratule à feuilles de Chanvre d'eau
- Orthotric de Roger
Faune d'intérêt communautaire :
- Insectes : Rosalie des Alpes*, Grand Capricorne, Lucane cerf-volant, Damier de la Succise, Laineuse du prunellier, Écaille Chiné*, Azuré de la sanguisorbe, La Proserpine, L’Alexanor, L’Apollon, Le Semi-Apollon, L’Azuré du serpolet et La Magicienne denteléeL.
- Amphibiens : parmi les espèces inscrites à l'annexe 2 de la Directives Habitats, seul le Sonneur à ventre jaune est présent au sud-est du site. Son habitat est vulnérable aux dégradations anthropiques comme à celles liées à la dynamique naturelle.
- Mammifères : 24 espèces de Chiroptères recensées : enjeu fort sur ces espèces mais les gîtes de reproduction connus sont pour la plupart à l'extérieur du site. Le lynx et le loup sont présents sur le site au moins de façon occasionnelle.
Au total, 25 espèces végétales et animales inscrites à l'Annexe II sont recensées sur le site Natura 2000.
NB : ce site ne relève pas de la Directive Oiseaux, à l'exception d'une toute petite partie concernée par la ZPS "Bois du Chapitre". Il abrite toutefois une avifaune de montagne bien diversifiée comprenant des éléments alpins (lagopède par exemple) et des espèces plus thermophiles.
Les espèces patrimoniales non concernées par la Directive Habitats sont très nombreuses, comprenant notamment une flore endémique remarquable autour du Pic de Bure.
